Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PnckQ9QYK9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PnckQ9QYK9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PnckQ9QYK9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PnckQ9QYK9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PnckQ9QYK9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PnckQ9QYK9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PnckQ9QYK9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PnckQ9QYK9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PnckQ9QYK9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PnckQ9QYK9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PnckQ9QYK9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PnckQ9QYK9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PnckQ9QYK9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PnckQ9QYK9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PnckQ9QYK9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PnckQ9QYK9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PnckQ9QYK9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms