Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx4Q9QY61 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx4Q9QY61 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx4Q9QY61 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx4Q9QY61 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx4Q9QY61 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx4Q9QY61 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Irx4Q9QY61 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irx4Q9QY61 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irx4Q9QY61 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irx4Q9QY61 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irx4Q9QY61 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx4Q9QY61 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Irx4Q9QY61 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irx4Q9QY61 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms