Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf354bQ9QXT9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf354bQ9QXT9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf354bQ9QXT9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf354bQ9QXT9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf354bQ9QXT9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf354bQ9QXT9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf354bQ9QXT9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf354bQ9QXT9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf354bQ9QXT9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf354bQ9QXT9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf354bQ9QXT9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf354bQ9QXT9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf354bQ9QXT9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf354bQ9QXT9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf354bQ9QXT9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf354bQ9QXT9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf354bQ9QXT9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf354bQ9QXT9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf354bQ9QXT9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf354bQ9QXT9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf354bQ9QXT9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf354bQ9QXT9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf354bQ9QXT9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf354bQ9QXT9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf354bQ9QXT9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf354bQ9QXT9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf354bQ9QXT9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf354bQ9QXT9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf354bQ9QXT9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf354bQ9QXT9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf354bQ9QXT9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf354bQ9QXT9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf354bQ9QXT9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf354bQ9QXT9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf354bQ9QXT9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf354bQ9QXT9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf354bQ9QXT9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf354bQ9QXT9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf354bQ9QXT9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf354bQ9QXT9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf354bQ9QXT9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf354bQ9QXT9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf354bQ9QXT9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf354bQ9QXT9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf354bQ9QXT9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf354bQ9QXT9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf354bQ9QXT9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf354bQ9QXT9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf354bQ9QXT9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf354bQ9QXT9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf354bQ9QXT9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf354bQ9QXT9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf354bQ9QXT9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf354bQ9QXT9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf354bQ9QXT9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms