Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tcea2Q9QVN7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Tcea2Q9QVN7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcea2Q9QVN7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcea2Q9QVN7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms