Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
REREQ9P2R6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.15■■■■□ 3.7
REREQ9P2R6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
REREQ9P2R6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
REREQ9P2R6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
REREQ9P2R6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
REREQ9P2R6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
REREQ9P2R6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
REREQ9P2R6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
REREQ9P2R6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
REREQ9P2R6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
REREQ9P2R6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
REREQ9P2R6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
REREQ9P2R6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
REREQ9P2R6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
REREQ9P2R6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
REREQ9P2R6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
REREQ9P2R6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
REREQ9P2R6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
REREQ9P2R6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
REREQ9P2R6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.09■■■■□ 3.69
REREQ9P2R6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
REREQ9P2R6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
REREQ9P2R6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
REREQ9P2R6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
REREQ9P2R6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
REREQ9P2R6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
REREQ9P2R6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
REREQ9P2R6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
REREQ9P2R6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
REREQ9P2R6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
REREQ9P2R6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
REREQ9P2R6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
REREQ9P2R6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
REREQ9P2R6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
REREQ9P2R6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
REREQ9P2R6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
REREQ9P2R6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
REREQ9P2R6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
REREQ9P2R6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
REREQ9P2R6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
REREQ9P2R6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
REREQ9P2R6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC38■■■■□ 3.67
REREQ9P2R6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3.67
REREQ9P2R6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
REREQ9P2R6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
REREQ9P2R6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
REREQ9P2R6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
REREQ9P2R6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
REREQ9P2R6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
REREQ9P2R6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
REREQ9P2R6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
REREQ9P2R6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
REREQ9P2R6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
REREQ9P2R6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
REREQ9P2R6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
REREQ9P2R6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
REREQ9P2R6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
REREQ9P2R6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
REREQ9P2R6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
REREQ9P2R6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
REREQ9P2R6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
REREQ9P2R6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
REREQ9P2R6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
REREQ9P2R6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
REREQ9P2R6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
REREQ9P2R6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
REREQ9P2R6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
REREQ9P2R6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
REREQ9P2R6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
REREQ9P2R6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms