Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H3

IFT80, Intraflagellar transport protein 80 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT80Q9P2H3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT80Q9P2H3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT80Q9P2H3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT80Q9P2H3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT80Q9P2H3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT80Q9P2H3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT80Q9P2H3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT80Q9P2H3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT80Q9P2H3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT80Q9P2H3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT80Q9P2H3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT80Q9P2H3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT80Q9P2H3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT80Q9P2H3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT80Q9P2H3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT80Q9P2H3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT80Q9P2H3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT80Q9P2H3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT80Q9P2H3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT80Q9P2H3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFT80Q9P2H3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT80Q9P2H3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT80Q9P2H3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT80Q9P2H3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT80Q9P2H3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT80Q9P2H3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT80Q9P2H3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT80Q9P2H3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT80Q9P2H3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT80Q9P2H3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT80Q9P2H3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT80Q9P2H3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT80Q9P2H3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT80Q9P2H3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT80Q9P2H3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT80Q9P2H3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms