Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CHD7Q9P2D1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHD7Q9P2D1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHD7Q9P2D1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms