Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMOD4Q9NZQ9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMOD4Q9NZQ9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMOD4Q9NZQ9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMOD4Q9NZQ9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMOD4Q9NZQ9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TMOD4Q9NZQ9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMOD4Q9NZQ9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMOD4Q9NZQ9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMOD4Q9NZQ9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TMOD4Q9NZQ9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMOD4Q9NZQ9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD4Q9NZQ9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD4Q9NZQ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMOD4Q9NZQ9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMOD4Q9NZQ9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms