Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EHD2Q9NZN4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EHD2Q9NZN4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EHD2Q9NZN4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EHD2Q9NZN4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EHD2Q9NZN4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EHD2Q9NZN4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EHD2Q9NZN4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EHD2Q9NZN4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EHD2Q9NZN4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EHD2Q9NZN4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EHD2Q9NZN4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EHD2Q9NZN4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EHD2Q9NZN4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EHD2Q9NZN4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EHD2Q9NZN4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EHD2Q9NZN4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms