Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CDK12Q9NYV4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CDK12Q9NYV4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CDK12Q9NYV4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CDK12Q9NYV4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CDK12Q9NYV4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CDK12Q9NYV4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CDK12Q9NYV4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CDK12Q9NYV4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CDK12Q9NYV4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CDK12Q9NYV4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
CDK12Q9NYV4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CDK12Q9NYV4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CDK12Q9NYV4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CDK12Q9NYV4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CDK12Q9NYV4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
CDK12Q9NYV4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CDK12Q9NYV4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
CDK12Q9NYV4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDK12Q9NYV4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDK12Q9NYV4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDK12Q9NYV4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDK12Q9NYV4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CDK12Q9NYV4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CDK12Q9NYV4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CDK12Q9NYV4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CDK12Q9NYV4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CDK12Q9NYV4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CDK12Q9NYV4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CDK12Q9NYV4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CDK12Q9NYV4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CDK12Q9NYV4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CDK12Q9NYV4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CDK12Q9NYV4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CDK12Q9NYV4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CDK12Q9NYV4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CDK12Q9NYV4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CDK12Q9NYV4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CDK12Q9NYV4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CDK12Q9NYV4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CDK12Q9NYV4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CDK12Q9NYV4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CDK12Q9NYV4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CDK12Q9NYV4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CDK12Q9NYV4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CDK12Q9NYV4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CDK12Q9NYV4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CDK12Q9NYV4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CDK12Q9NYV4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CDK12Q9NYV4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CDK12Q9NYV4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CDK12Q9NYV4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CDK12Q9NYV4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CDK12Q9NYV4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CDK12Q9NYV4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CDK12Q9NYV4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CDK12Q9NYV4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CDK12Q9NYV4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CDK12Q9NYV4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CDK12Q9NYV4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CDK12Q9NYV4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CDK12Q9NYV4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CDK12Q9NYV4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CDK12Q9NYV4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CDK12Q9NYV4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CDK12Q9NYV4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
CDK12Q9NYV4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CDK12Q9NYV4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CDK12Q9NYV4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CDK12Q9NYV4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CDK12Q9NYV4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CDK12Q9NYV4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CDK12Q9NYV4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms