Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLN6Q9NWW5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLN6Q9NWW5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLN6Q9NWW5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLN6Q9NWW5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLN6Q9NWW5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLN6Q9NWW5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLN6Q9NWW5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLN6Q9NWW5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLN6Q9NWW5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLN6Q9NWW5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLN6Q9NWW5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLN6Q9NWW5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLN6Q9NWW5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLN6Q9NWW5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLN6Q9NWW5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLN6Q9NWW5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLN6Q9NWW5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLN6Q9NWW5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLN6Q9NWW5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLN6Q9NWW5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLN6Q9NWW5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms