Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF9

RNF216, E3 ubiquitin-protein ligase RNF216, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF216Q9NWF9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF216Q9NWF9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF216Q9NWF9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF216Q9NWF9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF216Q9NWF9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF216Q9NWF9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF216Q9NWF9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF216Q9NWF9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF216Q9NWF9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF216Q9NWF9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF216Q9NWF9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms