Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
IFT57Q9NWB7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
IFT57Q9NWB7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
IFT57Q9NWB7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
IFT57Q9NWB7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
IFT57Q9NWB7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
IFT57Q9NWB7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
IFT57Q9NWB7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
IFT57Q9NWB7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
IFT57Q9NWB7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
IFT57Q9NWB7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
IFT57Q9NWB7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
IFT57Q9NWB7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
IFT57Q9NWB7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
IFT57Q9NWB7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
IFT57Q9NWB7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
IFT57Q9NWB7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
IFT57Q9NWB7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
IFT57Q9NWB7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
IFT57Q9NWB7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
IFT57Q9NWB7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
IFT57Q9NWB7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
IFT57Q9NWB7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
IFT57Q9NWB7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
IFT57Q9NWB7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
IFT57Q9NWB7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
IFT57Q9NWB7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
IFT57Q9NWB7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
IFT57Q9NWB7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
IFT57Q9NWB7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
IFT57Q9NWB7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
IFT57Q9NWB7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
IFT57Q9NWB7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
IFT57Q9NWB7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
IFT57Q9NWB7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
IFT57Q9NWB7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
IFT57Q9NWB7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
IFT57Q9NWB7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
IFT57Q9NWB7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
IFT57Q9NWB7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
IFT57Q9NWB7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
IFT57Q9NWB7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
IFT57Q9NWB7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
IFT57Q9NWB7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
IFT57Q9NWB7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
IFT57Q9NWB7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
IFT57Q9NWB7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
IFT57Q9NWB7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
IFT57Q9NWB7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
IFT57Q9NWB7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
IFT57Q9NWB7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
IFT57Q9NWB7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms