Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RBM28Q9NW13 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RBM28Q9NW13 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RBM28Q9NW13 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RBM28Q9NW13 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RBM28Q9NW13 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RBM28Q9NW13 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RBM28Q9NW13 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RBM28Q9NW13 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RBM28Q9NW13 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RBM28Q9NW13 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RBM28Q9NW13 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RBM28Q9NW13 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RBM28Q9NW13 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RBM28Q9NW13 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RBM28Q9NW13 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RBM28Q9NW13 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RBM28Q9NW13 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RBM28Q9NW13 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RBM28Q9NW13 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RBM28Q9NW13 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RBM28Q9NW13 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RBM28Q9NW13 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM28Q9NW13 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM28Q9NW13 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM28Q9NW13 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBM28Q9NW13 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBM28Q9NW13 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RBM28Q9NW13 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RBM28Q9NW13 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RBM28Q9NW13 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RBM28Q9NW13 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RBM28Q9NW13 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RBM28Q9NW13 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM28Q9NW13 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM28Q9NW13 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM28Q9NW13 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM28Q9NW13 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM28Q9NW13 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM28Q9NW13 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM28Q9NW13 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBM28Q9NW13 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBM28Q9NW13 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBM28Q9NW13 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBM28Q9NW13 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM28Q9NW13 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM28Q9NW13 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM28Q9NW13 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBM28Q9NW13 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBM28Q9NW13 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBM28Q9NW13 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBM28Q9NW13 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBM28Q9NW13 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM28Q9NW13 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM28Q9NW13 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RBM28Q9NW13 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM28Q9NW13 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM28Q9NW13 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM28Q9NW13 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM28Q9NW13 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM28Q9NW13 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM28Q9NW13 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM28Q9NW13 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RBM28Q9NW13 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RBM28Q9NW13 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RBM28Q9NW13 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RBM28Q9NW13 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RBM28Q9NW13 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM28Q9NW13 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM28Q9NW13 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM28Q9NW13 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM28Q9NW13 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM28Q9NW13 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM28Q9NW13 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM28Q9NW13 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM28Q9NW13 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms