Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR3EQ9NVU0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLR3EQ9NVU0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR3EQ9NVU0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms