Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NDFIP2Q9NV92 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NDFIP2Q9NV92 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NDFIP2Q9NV92 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDFIP2Q9NV92 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDFIP2Q9NV92 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDFIP2Q9NV92 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDFIP2Q9NV92 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDFIP2Q9NV92 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NDFIP2Q9NV92 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NDFIP2Q9NV92 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NDFIP2Q9NV92 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NDFIP2Q9NV92 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NDFIP2Q9NV92 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NDFIP2Q9NV92 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NDFIP2Q9NV92 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NDFIP2Q9NV92 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NDFIP2Q9NV92 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NDFIP2Q9NV92 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NDFIP2Q9NV92 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NDFIP2Q9NV92 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NDFIP2Q9NV92 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NDFIP2Q9NV92 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDFIP2Q9NV92 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDFIP2Q9NV92 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDFIP2Q9NV92 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDFIP2Q9NV92 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDFIP2Q9NV92 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDFIP2Q9NV92 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDFIP2Q9NV92 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDFIP2Q9NV92 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDFIP2Q9NV92 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDFIP2Q9NV92 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDFIP2Q9NV92 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDFIP2Q9NV92 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDFIP2Q9NV92 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NDFIP2Q9NV92 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NDFIP2Q9NV92 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NDFIP2Q9NV92 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDFIP2Q9NV92 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDFIP2Q9NV92 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms