Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCF3Q9NUQ8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF3Q9NUQ8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCF3Q9NUQ8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCF3Q9NUQ8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms