Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCM2LQ9NUG4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCM2LQ9NUG4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCM2LQ9NUG4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCM2LQ9NUG4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCM2LQ9NUG4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCM2LQ9NUG4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms