Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
GINM1Q9NU53 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GINM1Q9NU53 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GINM1Q9NU53 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GINM1Q9NU53 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GINM1Q9NU53 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GINM1Q9NU53 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GINM1Q9NU53 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GINM1Q9NU53 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GINM1Q9NU53 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GINM1Q9NU53 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GINM1Q9NU53 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GINM1Q9NU53 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GINM1Q9NU53 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GINM1Q9NU53 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GINM1Q9NU53 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GINM1Q9NU53 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GINM1Q9NU53 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GINM1Q9NU53 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GINM1Q9NU53 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GINM1Q9NU53 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms