Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOMER3Q9NSC5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOMER3Q9NSC5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOMER3Q9NSC5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms