Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPORSQ9NS56 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPORSQ9NS56 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPORSQ9NS56 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPORSQ9NS56 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPORSQ9NS56 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPORSQ9NS56 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPORSQ9NS56 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPORSQ9NS56 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOPORSQ9NS56 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOPORSQ9NS56 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOPORSQ9NS56 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPORSQ9NS56 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPORSQ9NS56 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPORSQ9NS56 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPORSQ9NS56 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPORSQ9NS56 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOPORSQ9NS56 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOPORSQ9NS56 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOPORSQ9NS56 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOPORSQ9NS56 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.51■■■□□ 2
TOPORSQ9NS56 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOPORSQ9NS56 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOPORSQ9NS56 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms