Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG7

SDR39U1, Epimerase family protein SDR39U1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR39U1Q9NRG7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SDR39U1Q9NRG7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SDR39U1Q9NRG7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDR39U1Q9NRG7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDR39U1Q9NRG7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDR39U1Q9NRG7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SDR39U1Q9NRG7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDR39U1Q9NRG7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDR39U1Q9NRG7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDR39U1Q9NRG7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SDR39U1Q9NRG7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDR39U1Q9NRG7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDR39U1Q9NRG7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDR39U1Q9NRG7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDR39U1Q9NRG7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SDR39U1Q9NRG7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDR39U1Q9NRG7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDR39U1Q9NRG7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDR39U1Q9NRG7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDR39U1Q9NRG7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDR39U1Q9NRG7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDR39U1Q9NRG7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDR39U1Q9NRG7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDR39U1Q9NRG7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDR39U1Q9NRG7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDR39U1Q9NRG7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDR39U1Q9NRG7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SDR39U1Q9NRG7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SDR39U1Q9NRG7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDR39U1Q9NRG7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDR39U1Q9NRG7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms