Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
DUOX2Q9NRD8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
DUOX2Q9NRD8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
DUOX2Q9NRD8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
DUOX2Q9NRD8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
DUOX2Q9NRD8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
DUOX2Q9NRD8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
DUOX2Q9NRD8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
DUOX2Q9NRD8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
DUOX2Q9NRD8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
DUOX2Q9NRD8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
DUOX2Q9NRD8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
DUOX2Q9NRD8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
DUOX2Q9NRD8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
DUOX2Q9NRD8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
DUOX2Q9NRD8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
DUOX2Q9NRD8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.64
DUOX2Q9NRD8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
DUOX2Q9NRD8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
DUOX2Q9NRD8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
DUOX2Q9NRD8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
DUOX2Q9NRD8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
DUOX2Q9NRD8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
DUOX2Q9NRD8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
DUOX2Q9NRD8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
DUOX2Q9NRD8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
DUOX2Q9NRD8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
DUOX2Q9NRD8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
DUOX2Q9NRD8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
DUOX2Q9NRD8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
DUOX2Q9NRD8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
DUOX2Q9NRD8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
DUOX2Q9NRD8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
DUOX2Q9NRD8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
DUOX2Q9NRD8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
DUOX2Q9NRD8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
DUOX2Q9NRD8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
DUOX2Q9NRD8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
DUOX2Q9NRD8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
DUOX2Q9NRD8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
DUOX2Q9NRD8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
DUOX2Q9NRD8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
DUOX2Q9NRD8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
DUOX2Q9NRD8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
DUOX2Q9NRD8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
DUOX2Q9NRD8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
DUOX2Q9NRD8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
DUOX2Q9NRD8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
DUOX2Q9NRD8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
DUOX2Q9NRD8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
DUOX2Q9NRD8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
DUOX2Q9NRD8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
DUOX2Q9NRD8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
DUOX2Q9NRD8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
DUOX2Q9NRD8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
DUOX2Q9NRD8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
DUOX2Q9NRD8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
DUOX2Q9NRD8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
DUOX2Q9NRD8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.68■■■■□ 3.62
DUOX2Q9NRD8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
DUOX2Q9NRD8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
DUOX2Q9NRD8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
DUOX2Q9NRD8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
DUOX2Q9NRD8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
DUOX2Q9NRD8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
DUOX2Q9NRD8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
DUOX2Q9NRD8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
DUOX2Q9NRD8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
DUOX2Q9NRD8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
DUOX2Q9NRD8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
DUOX2Q9NRD8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
DUOX2Q9NRD8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
DUOX2Q9NRD8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
DUOX2Q9NRD8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
DUOX2Q9NRD8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
DUOX2Q9NRD8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
DUOX2Q9NRD8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
DUOX2Q9NRD8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
DUOX2Q9NRD8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
DUOX2Q9NRD8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
DUOX2Q9NRD8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.6■■■■□ 3.61
DUOX2Q9NRD8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
DUOX2Q9NRD8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
DUOX2Q9NRD8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
DUOX2Q9NRD8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
DUOX2Q9NRD8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
DUOX2Q9NRD8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
DUOX2Q9NRD8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
DUOX2Q9NRD8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
DUOX2Q9NRD8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
DUOX2Q9NRD8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
DUOX2Q9NRD8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
DUOX2Q9NRD8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
DUOX2Q9NRD8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
DUOX2Q9NRD8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
DUOX2Q9NRD8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
DUOX2Q9NRD8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
DUOX2Q9NRD8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
DUOX2Q9NRD8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
DUOX2Q9NRD8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms