Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAR1AQ9NR31 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAR1AQ9NR31 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAR1AQ9NR31 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAR1AQ9NR31 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAR1AQ9NR31 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAR1AQ9NR31 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAR1AQ9NR31 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAR1AQ9NR31 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAR1AQ9NR31 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAR1AQ9NR31 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAR1AQ9NR31 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAR1AQ9NR31 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAR1AQ9NR31 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAR1AQ9NR31 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SAR1AQ9NR31 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAR1AQ9NR31 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAR1AQ9NR31 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAR1AQ9NR31 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAR1AQ9NR31 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAR1AQ9NR31 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAR1AQ9NR31 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SAR1AQ9NR31 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SAR1AQ9NR31 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms