Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPHNQ9NQX3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPHNQ9NQX3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPHNQ9NQX3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GPHNQ9NQX3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GPHNQ9NQX3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GPHNQ9NQX3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GPHNQ9NQX3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GPHNQ9NQX3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GPHNQ9NQX3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPHNQ9NQX3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPHNQ9NQX3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPHNQ9NQX3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GPHNQ9NQX3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GPHNQ9NQX3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GPHNQ9NQX3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GPHNQ9NQX3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GPHNQ9NQX3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GPHNQ9NQX3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GPHNQ9NQX3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GPHNQ9NQX3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GPHNQ9NQX3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GPHNQ9NQX3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GPHNQ9NQX3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GPHNQ9NQX3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GPHNQ9NQX3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
GPHNQ9NQX3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GPHNQ9NQX3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GPHNQ9NQX3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GPHNQ9NQX3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GPHNQ9NQX3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GPHNQ9NQX3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GPHNQ9NQX3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GPHNQ9NQX3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GPHNQ9NQX3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GPHNQ9NQX3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GPHNQ9NQX3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GPHNQ9NQX3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
GPHNQ9NQX3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
GPHNQ9NQX3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPHNQ9NQX3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPHNQ9NQX3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GPHNQ9NQX3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
GPHNQ9NQX3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPHNQ9NQX3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPHNQ9NQX3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPHNQ9NQX3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GPHNQ9NQX3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPHNQ9NQX3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPHNQ9NQX3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPHNQ9NQX3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GPHNQ9NQX3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GPHNQ9NQX3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GPHNQ9NQX3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GPHNQ9NQX3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GPHNQ9NQX3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GPHNQ9NQX3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GPHNQ9NQX3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GPHNQ9NQX3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GPHNQ9NQX3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GPHNQ9NQX3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GPHNQ9NQX3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GPHNQ9NQX3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GPHNQ9NQX3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPHNQ9NQX3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPHNQ9NQX3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPHNQ9NQX3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPHNQ9NQX3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPHNQ9NQX3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPHNQ9NQX3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPHNQ9NQX3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPHNQ9NQX3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPHNQ9NQX3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GPHNQ9NQX3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GPHNQ9NQX3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GPHNQ9NQX3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GPHNQ9NQX3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GPHNQ9NQX3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GPHNQ9NQX3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GPHNQ9NQX3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GPHNQ9NQX3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GPHNQ9NQX3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GPHNQ9NQX3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GPHNQ9NQX3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GPHNQ9NQX3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms