Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL40Q9NQ50 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL40Q9NQ50 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL40Q9NQ50 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms