Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCRT2Q9NQ03 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRT2Q9NQ03 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCRT2Q9NQ03 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms