Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRC4Q9NPP4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRC4Q9NPP4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRC4Q9NPP4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRC4Q9NPP4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRC4Q9NPP4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRC4Q9NPP4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRC4Q9NPP4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRC4Q9NPP4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRC4Q9NPP4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRC4Q9NPP4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRC4Q9NPP4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRC4Q9NPP4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRC4Q9NPP4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRC4Q9NPP4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRC4Q9NPP4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRC4Q9NPP4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRC4Q9NPP4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRC4Q9NPP4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRC4Q9NPP4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRC4Q9NPP4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRC4Q9NPP4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRC4Q9NPP4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms