Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRCC1Q9NPI7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRCC1Q9NPI7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRCC1Q9NPI7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms