Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PNPLA8Q9NP80 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PNPLA8Q9NP80 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNPLA8Q9NP80 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.7 ms