Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSU72Q9NP77 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSU72Q9NP77 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SSU72Q9NP77 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms