Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARFGAP3Q9NP61 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARFGAP3Q9NP61 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms