Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sfmbt1Q9JMD1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sfmbt1Q9JMD1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sfmbt1Q9JMD1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sfmbt1Q9JMD1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sfmbt1Q9JMD1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sfmbt1Q9JMD1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sfmbt1Q9JMD1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sfmbt1Q9JMD1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sfmbt1Q9JMD1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sfmbt1Q9JMD1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sfmbt1Q9JMD1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sfmbt1Q9JMD1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sfmbt1Q9JMD1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sfmbt1Q9JMD1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sfmbt1Q9JMD1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sfmbt1Q9JMD1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sfmbt1Q9JMD1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sfmbt1Q9JMD1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sfmbt1Q9JMD1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sfmbt1Q9JMD1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sfmbt1Q9JMD1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sfmbt1Q9JMD1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms