Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PnkpQ9JLV6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PnkpQ9JLV6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PnkpQ9JLV6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PnkpQ9JLV6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PnkpQ9JLV6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PnkpQ9JLV6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PnkpQ9JLV6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PnkpQ9JLV6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PnkpQ9JLV6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PnkpQ9JLV6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PnkpQ9JLV6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PnkpQ9JLV6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PnkpQ9JLV6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PnkpQ9JLV6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PnkpQ9JLV6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PnkpQ9JLV6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PnkpQ9JLV6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PnkpQ9JLV6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PnkpQ9JLV6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PnkpQ9JLV6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PnkpQ9JLV6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PnkpQ9JLV6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PnkpQ9JLV6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PnkpQ9JLV6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PnkpQ9JLV6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PnkpQ9JLV6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PnkpQ9JLV6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PnkpQ9JLV6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PnkpQ9JLV6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PnkpQ9JLV6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PnkpQ9JLV6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PnkpQ9JLV6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PnkpQ9JLV6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PnkpQ9JLV6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PnkpQ9JLV6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PnkpQ9JLV6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PnkpQ9JLV6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PnkpQ9JLV6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PnkpQ9JLV6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PnkpQ9JLV6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PnkpQ9JLV6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms