Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc4apQ9JLV2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc4apQ9JLV2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc4apQ9JLV2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc4apQ9JLV2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc4apQ9JLV2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc4apQ9JLV2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc4apQ9JLV2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc4apQ9JLV2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc4apQ9JLV2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc4apQ9JLV2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc4apQ9JLV2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc4apQ9JLV2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms