Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Col5a3Q9JLI2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col5a3Q9JLI2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col5a3Q9JLI2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col5a3Q9JLI2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col5a3Q9JLI2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Col5a3Q9JLI2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Col5a3Q9JLI2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col5a3Q9JLI2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col5a3Q9JLI2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col5a3Q9JLI2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col5a3Q9JLI2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Col5a3Q9JLI2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col5a3Q9JLI2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col5a3Q9JLI2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Col5a3Q9JLI2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col5a3Q9JLI2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col5a3Q9JLI2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col5a3Q9JLI2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col5a3Q9JLI2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col5a3Q9JLI2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col5a3Q9JLI2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col5a3Q9JLI2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col5a3Q9JLI2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col5a3Q9JLI2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col5a3Q9JLI2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col5a3Q9JLI2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col5a3Q9JLI2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col5a3Q9JLI2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col5a3Q9JLI2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col5a3Q9JLI2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Col5a3Q9JLI2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col5a3Q9JLI2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col5a3Q9JLI2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col5a3Q9JLI2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col5a3Q9JLI2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col5a3Q9JLI2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Col5a3Q9JLI2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col5a3Q9JLI2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Col5a3Q9JLI2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col5a3Q9JLI2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col5a3Q9JLI2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col5a3Q9JLI2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col5a3Q9JLI2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col5a3Q9JLI2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col5a3Q9JLI2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col5a3Q9JLI2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col5a3Q9JLI2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col5a3Q9JLI2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Col5a3Q9JLI2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col5a3Q9JLI2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col5a3Q9JLI2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col5a3Q9JLI2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col5a3Q9JLI2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col5a3Q9JLI2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col5a3Q9JLI2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col5a3Q9JLI2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col5a3Q9JLI2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col5a3Q9JLI2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col5a3Q9JLI2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col5a3Q9JLI2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col5a3Q9JLI2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col5a3Q9JLI2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col5a3Q9JLI2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col5a3Q9JLI2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col5a3Q9JLI2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col5a3Q9JLI2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col5a3Q9JLI2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col5a3Q9JLI2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col5a3Q9JLI2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col5a3Q9JLI2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col5a3Q9JLI2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col5a3Q9JLI2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col5a3Q9JLI2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col5a3Q9JLI2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col5a3Q9JLI2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col5a3Q9JLI2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col5a3Q9JLI2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Col5a3Q9JLI2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col5a3Q9JLI2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col5a3Q9JLI2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col5a3Q9JLI2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col5a3Q9JLI2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col5a3Q9JLI2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col5a3Q9JLI2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col5a3Q9JLI2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col5a3Q9JLI2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col5a3Q9JLI2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col5a3Q9JLI2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col5a3Q9JLI2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col5a3Q9JLI2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
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