Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SacsQ9JLC8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SacsQ9JLC8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SacsQ9JLC8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SacsQ9JLC8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SacsQ9JLC8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SacsQ9JLC8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SacsQ9JLC8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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