Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx5Q9JKQ4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx5Q9JKQ4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx5Q9JKQ4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx5Q9JKQ4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx5Q9JKQ4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx5Q9JKQ4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx5Q9JKQ4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx5Q9JKQ4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx5Q9JKQ4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx5Q9JKQ4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx5Q9JKQ4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx5Q9JKQ4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx5Q9JKQ4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Irx5Q9JKQ4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx5Q9JKQ4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Irx5Q9JKQ4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Irx5Q9JKQ4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irx5Q9JKQ4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irx5Q9JKQ4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx5Q9JKQ4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx5Q9JKQ4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx5Q9JKQ4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx5Q9JKQ4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx5Q9JKQ4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx5Q9JKQ4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx5Q9JKQ4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx5Q9JKQ4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx5Q9JKQ4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx5Q9JKQ4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx5Q9JKQ4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx5Q9JKQ4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx5Q9JKQ4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx5Q9JKQ4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx5Q9JKQ4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irx5Q9JKQ4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irx5Q9JKQ4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx5Q9JKQ4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx5Q9JKQ4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx5Q9JKQ4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx5Q9JKQ4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx5Q9JKQ4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx5Q9JKQ4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx5Q9JKQ4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx5Q9JKQ4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx5Q9JKQ4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx5Q9JKQ4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx5Q9JKQ4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx5Q9JKQ4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irx5Q9JKQ4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Irx5Q9JKQ4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irx5Q9JKQ4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms