Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pole3Q9JKP7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pole3Q9JKP7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pole3Q9JKP7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pole3Q9JKP7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pole3Q9JKP7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pole3Q9JKP7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pole3Q9JKP7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pole3Q9JKP7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pole3Q9JKP7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pole3Q9JKP7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pole3Q9JKP7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pole3Q9JKP7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pole3Q9JKP7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pole3Q9JKP7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pole3Q9JKP7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pole3Q9JKP7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pole3Q9JKP7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pole3Q9JKP7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pole3Q9JKP7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pole3Q9JKP7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pole3Q9JKP7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pole3Q9JKP7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pole3Q9JKP7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pole3Q9JKP7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms