Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AtrQ9JKK8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AtrQ9JKK8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AtrQ9JKK8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AtrQ9JKK8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AtrQ9JKK8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AtrQ9JKK8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AtrQ9JKK8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtrQ9JKK8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtrQ9JKK8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtrQ9JKK8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AtrQ9JKK8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtrQ9JKK8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AtrQ9JKK8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtrQ9JKK8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtrQ9JKK8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtrQ9JKK8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtrQ9JKK8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AtrQ9JKK8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AtrQ9JKK8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AtrQ9JKK8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AtrQ9JKK8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AtrQ9JKK8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AtrQ9JKK8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms