Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Ap3m1Q9JKC8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3m1Q9JKC8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3m1Q9JKC8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3m1Q9JKC8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3m1Q9JKC8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3m1Q9JKC8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3m1Q9JKC8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3m1Q9JKC8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3m1Q9JKC8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3m1Q9JKC8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3m1Q9JKC8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3m1Q9JKC8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3m1Q9JKC8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3m1Q9JKC8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3m1Q9JKC8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3m1Q9JKC8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ap3m1Q9JKC8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ap3m1Q9JKC8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3m1Q9JKC8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap3m1Q9JKC8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms