Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smco4Q9JIS3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smco4Q9JIS3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smco4Q9JIS3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smco4Q9JIS3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smco4Q9JIS3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smco4Q9JIS3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smco4Q9JIS3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco4Q9JIS3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco4Q9JIS3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco4Q9JIS3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco4Q9JIS3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco4Q9JIS3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco4Q9JIS3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco4Q9JIS3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco4Q9JIS3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco4Q9JIS3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms