Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tssc4Q9JHE7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tssc4Q9JHE7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tssc4Q9JHE7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tssc4Q9JHE7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tssc4Q9JHE7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tssc4Q9JHE7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tssc4Q9JHE7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tssc4Q9JHE7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tssc4Q9JHE7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tssc4Q9JHE7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tssc4Q9JHE7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tssc4Q9JHE7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tssc4Q9JHE7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tssc4Q9JHE7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tssc4Q9JHE7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tssc4Q9JHE7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Tssc4Q9JHE7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tssc4Q9JHE7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tssc4Q9JHE7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tssc4Q9JHE7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tssc4Q9JHE7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tssc4Q9JHE7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tssc4Q9JHE7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tssc4Q9JHE7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tssc4Q9JHE7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tssc4Q9JHE7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tssc4Q9JHE7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms