Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XAB2Q9HCS7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
XAB2Q9HCS7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XAB2Q9HCS7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XAB2Q9HCS7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XAB2Q9HCS7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XAB2Q9HCS7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XAB2Q9HCS7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms