Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KIAA1549Q9HCM3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIAA1549Q9HCM3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIAA1549Q9HCM3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms