Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC98

NEK6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK6Q9HC98 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEK6Q9HC98 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK6Q9HC98 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEK6Q9HC98 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEK6Q9HC98 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEK6Q9HC98 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEK6Q9HC98 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms