Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTN4Q9HB63 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTN4Q9HB63 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTN4Q9HB63 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTN4Q9HB63 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms