Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP110Q9HB58 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SP110Q9HB58 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP110Q9HB58 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP110Q9HB58 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP110Q9HB58 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP110Q9HB58 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP110Q9HB58 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP110Q9HB58 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP110Q9HB58 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP110Q9HB58 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP110Q9HB58 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP110Q9HB58 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP110Q9HB58 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP110Q9HB58 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP110Q9HB58 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP110Q9HB58 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP110Q9HB58 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SP110Q9HB58 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SP110Q9HB58 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SP110Q9HB58 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP110Q9HB58 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP110Q9HB58 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP110Q9HB58 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP110Q9HB58 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP110Q9HB58 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP110Q9HB58 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SP110Q9HB58 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP110Q9HB58 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP110Q9HB58 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SP110Q9HB58 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SP110Q9HB58 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP110Q9HB58 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SP110Q9HB58 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP110Q9HB58 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP110Q9HB58 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SP110Q9HB58 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SP110Q9HB58 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP110Q9HB58 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SP110Q9HB58 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP110Q9HB58 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SP110Q9HB58 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SP110Q9HB58 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SP110Q9HB58 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SP110Q9HB58 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SP110Q9HB58 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SP110Q9HB58 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SP110Q9HB58 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SP110Q9HB58 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SP110Q9HB58 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP110Q9HB58 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP110Q9HB58 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP110Q9HB58 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SP110Q9HB58 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SP110Q9HB58 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SP110Q9HB58 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SP110Q9HB58 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SP110Q9HB58 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SP110Q9HB58 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SP110Q9HB58 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SP110Q9HB58 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SP110Q9HB58 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SP110Q9HB58 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SP110Q9HB58 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP110Q9HB58 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP110Q9HB58 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP110Q9HB58 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP110Q9HB58 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP110Q9HB58 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms