Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CLSPNQ9HAW4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CLSPNQ9HAW4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CLSPNQ9HAW4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
CLSPNQ9HAW4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CLSPNQ9HAW4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CLSPNQ9HAW4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CLSPNQ9HAW4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CLSPNQ9HAW4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CLSPNQ9HAW4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CLSPNQ9HAW4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CLSPNQ9HAW4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CLSPNQ9HAW4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CLSPNQ9HAW4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CLSPNQ9HAW4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CLSPNQ9HAW4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CLSPNQ9HAW4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CLSPNQ9HAW4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CLSPNQ9HAW4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLSPNQ9HAW4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLSPNQ9HAW4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLSPNQ9HAW4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLSPNQ9HAW4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLSPNQ9HAW4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLSPNQ9HAW4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLSPNQ9HAW4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLSPNQ9HAW4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CLSPNQ9HAW4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CLSPNQ9HAW4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CLSPNQ9HAW4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CLSPNQ9HAW4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CLSPNQ9HAW4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
CLSPNQ9HAW4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CLSPNQ9HAW4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CLSPNQ9HAW4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CLSPNQ9HAW4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CLSPNQ9HAW4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CLSPNQ9HAW4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CLSPNQ9HAW4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CLSPNQ9HAW4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CLSPNQ9HAW4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CLSPNQ9HAW4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
CLSPNQ9HAW4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
CLSPNQ9HAW4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CLSPNQ9HAW4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CLSPNQ9HAW4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLSPNQ9HAW4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLSPNQ9HAW4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
CLSPNQ9HAW4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLSPNQ9HAW4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CLSPNQ9HAW4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CLSPNQ9HAW4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CLSPNQ9HAW4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CLSPNQ9HAW4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CLSPNQ9HAW4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CLSPNQ9HAW4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CLSPNQ9HAW4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CLSPNQ9HAW4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CLSPNQ9HAW4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CLSPNQ9HAW4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CLSPNQ9HAW4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CLSPNQ9HAW4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CLSPNQ9HAW4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CLSPNQ9HAW4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CLSPNQ9HAW4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CLSPNQ9HAW4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CLSPNQ9HAW4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CLSPNQ9HAW4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CLSPNQ9HAW4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CLSPNQ9HAW4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CLSPNQ9HAW4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CLSPNQ9HAW4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CLSPNQ9HAW4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CLSPNQ9HAW4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CLSPNQ9HAW4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CLSPNQ9HAW4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.2 ms