Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAT0

ROPN1, Ropporin-1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1Q9HAT0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROPN1Q9HAT0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ROPN1Q9HAT0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ROPN1Q9HAT0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ROPN1Q9HAT0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ROPN1Q9HAT0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms